Плата за негативное воздействие на окружающую среду поступает в бюджеты муниципальных районов и городских округов от природопользователей осуществляющих хозяйственную и иную деятельность на территории соответствующего муниципального образования в объёме 40%, в бюджет Субъекта РФ также в объёме 40% и в Федеральный бюджет в объёме 20%.